孙宇平 副教授

作者: 时间:2021-03-01 点击数:

 

所属学院:计算机学院

导师类别:硕士生导师

科研方向:模式识别、机器学习、计算生物学

联系方式:syp@gdut.edu.cn

硕士招生学院:计算机学院

 

个人简述

孙宇平现任广东工业大学计算机学院网络空间安全系副主任,副教授。2009年和2015年分别获华南理工大学计算机科学与工程学院工学学士和博士学位,201510月进入华南理工大学控制科学与工程博士后流动站从事科研工作,20183月以广东工业大学青年百人计划入职广东工业大学计算机学院。主要从事模式识别、机器学习及生物医学信息学等研究工作。作为项目负责人承担了国家级项目1项、省部级项目2项、市厅级项目1项、其他项目3项,作为核心成员先后参与了多项国家级、省部级、市厅级科研课题。目前已发表高水平学术论文26篇,其中SCI收录论文22篇,CCF/CAA推荐A/B类论文10篇。已有授权发明专利3件,已受理发明专利7件。

教育背景

2013.10-2015.04  国家公派联合培养博士生,新加坡国立大学,应用数学

2009.09-2015.06  博士(硕博连读),华南理工大学,计算机应用技术

2006.09-2009.06  学士,华南理工大学,计算机科学与技术(联合班)

工作经历

2018.03-至今        副教授(讲师2018.03-2021.01),广东工业大学

2015.10-2018.03     博士后,华南理工大学

学术兼职

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员,广东省精准医学应用学会医工结合分会委员会委员,广东省生物医学工程学会医疗机器人与人工智能分会委员,中国计算机学会(CCF)会员、中国生物工程学会终身会员、广东省生物医学工程学会会员。目前担任Briefings in Bioinformatics, Frontiers in Genetics, BMC BioinformaticsScientific reports, BMC Medical Informatics and Decision Making, Frontiers in Bioscience-Landmark等生物信息学领域重要期刊的审稿人。

近三年主要论文(通讯作者标*

[1] Haonan Huang, Yuping Sun (孙宇平)*, Meijing Lan*, Huizhe Zhang, Guobo Xie, “GNAEMDA: microbe-drug associations prediction on graph normalized convolutional network, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 10.1109/JBHI.2022.3233711, 2023. (IF: 5.772, SCI一区, CCF C)

[2] Qing Su, Enhai Ou, Yuping Sun (孙宇平)*, Chunyan Lv*, Guobo Xie, Haoqing Wang, Honglin Huang, “SimH: a novel representation learning model with activation and projection mechanisms for COVID-19 knowledge bases, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 26(12): 5859-5869, 2022. (IF: 5.772, SCI一区, CCF C)

[3] Guobo Xie, Zelin Jiang, Zhiyi Lin*, Guosheng Gu, Yuping Sun (孙宇平), Qing Su, Ji Cui, Huizhe Zhang, “DHOSGR: lncRNA-disease association prediction based on decay high-order similarity and graph-regularized matrix completion, Current Bioinformatics, 18: 92-104, 2022. (IF: 4.850, SCI四区)

[4] Guobo Xie, Haojie Xu, Jianming Li, Guosheng Gu*, Yuping Sun (孙宇平), Zhiyi Lin, Yinting Zhu, Weiming Wang, Youfu Wang, Jiang Shao, “DRPADC: A novel drug repositioning algorithm predicting adaptive drugs for COVID-19,” Computers & Chemical Engineering, 10.1016/j.compchemeng.2022.107947, 2022. (IF: 4.130, SCI二区)

[5] Guobo Xie, Yinting Zhu, Zhiyi Lin*, Yuping Sun (孙宇平), Guosheng Gu, Jianming Li, Weiming Wang, “HBRWRLDA: predicting potential lncRNA–disease associations based on hypergraph bi-random walk with restart,” Molecular Genetics and Genomics, 297:1215–1228, 2022. (IF: 3.291, SCI三区)

[6] Huizhe Zhang, Juntao Fang# , Yuping Sun (孙宇平)*, Guobo Xie, Zhiyi Lin, Guosheng Gu, “Predicting miRNA–disease associations via node-level attention graph auto-encoder,” IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 10.1109/TCBB.2022.3170843, 2022. (IF: 3.710, SCI三区, CCF B)

[7] Guobo Xie, Jiawei Jiang and Yuping Sun (孙宇平)*, LDA-LNSUBRW: lncRNA-disease association prediction based on linear neighborhood similarity and unbalanced bi-random walk, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 19(2): 989-997, 2022. (IF: 3.710, SCI三区, CCF B)

[8] Tianrong Chen, Jie Ling*, Yuping Sun (孙宇平), White-box content camouflage attacks against deep learning, Computers & Security, 117: 102676, 2022. (IF: 4.438, SCI三区, CCF B)

[9] Guobo Xie, Jianming Li, Guosheng Gu*, Yuping Sun (孙宇平), Zhiyi Lin, Yinting Zhu, and Weiming Wang “BGMSDDA:  A bipartite graph diffusion algorithm with multiple similarity integration for drug-disease association prediction, Molecular Omics, 17, 997-1011, 2021. (IF: 3.743, SCI四区)

[10] Guobo Xie, Hui Chen, Yuping Sun (孙宇平)*, Guosheng Gu, Zhiyi Lin, Weiming Wang, Jianming Li, “Predicting circRNA-disease associations based on deep matrix factorization with multi-source fusion,” Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 13(4), 582-594, 2021. (IF: 2.233, SCI三区)

[11] Guobo Xie, Yinting Zhu, Zhiyi Lin*, Yuping Sun (孙宇平), Guosheng Gu, Weiming Wang and Hui Chen, “HOPMCLDA: predicting lncRNA-disease association through High-Order Proximity and Matrix Completion,” Molecular Omics, 17, 760-768, 2021. (IF: 3.743, SCI四区)

[12] Guobo Xie, Bin Huang, Yuping Sun (孙宇平)*, Changhai Wu, Yuqiong Han, “RWSF-BLP: a novel lncRNA-disease association prediction model using random walk based multi-similarity fusion and bidirectional label propagation,” Molecular Genetics and Genomics, 296, 473–483, 2021. (IF: 3.291, SCI三区)

科研项目

1) 国家自然科学基金青年项目(62002070),在研,主持。

2) 广州市科技计划基础与应用基础研究项目(202102021236),在研,主持。

3) 中山大学广东省计算科学重点实验室开放课题基金(2021013),在研,主持。

4) 国家自然科学基金面上项目(62076073),在研,参与。

5) 广州市科技计划产业技术重大攻关计划(201902020006),在研,参与。

6) 国家自然科学基金面上项目(61872151),在研,参与。

7) 广东省科技计划协同创新与平台环境建设项目(2018A050506013),结题,参与。

8) 广东省自然科学基金博士启动项目(2017A030310364,结题,主持。

9) 广州市科技项目科学研究专项一般项目(201707010147),结题,参与。

10) 广东省自然科学基金面上项目(2017A030313382,结题,参与。

11) 国家自然科学基金面上项目(61672241),结题,参与。

12) 广东省自然科学基金面上项目(2016A030313516,结题,参与。

13) 国家自然科学基金面上项目(61273255),结题,参与。

个人主页及招生要求

https://teacher.gdut.edu.cn/sunyuping/zh_CN/index.htm

https://www.researchgate.net/profile/Yuping-Sun-7

 

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1. 先决条件:勤恳踏实、态度积极、品格端正,身体健康,思维开阔;

2. 有较好的编程功底,精通pythonmatlab为佳;

3. 计算机、生物、数学或医学工程专业背景;

4. 有意愿以后从事科研工作或人工智能算法开发者优先。

 

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