个人简述
孙宇平现任广东工业大学计算机学院网络空间安全系副主任,副教授。2009年和2015年分别获华南理工大学计算机科学与工程学院工学学士和博士学位,2015年10月进入华南理工大学控制科学与工程博士后流动站从事科研工作,2018年3月以广东工业大学青年百人计划入职广东工业大学计算机学院。主要从事模式识别、机器学习及生物医学信息学等研究工作。作为项目负责人承担了国家级项目1项、省部级项目2项、市厅级项目1项、其他项目3项,作为核心成员先后参与了多项国家级、省部级、市厅级科研课题。目前已发表高水平学术论文26篇,其中SCI收录论文22篇,CCF/CAA推荐A/B类论文10篇。已有授权发明专利3件,已受理发明专利7件。
教育背景
2013.10-2015.04 国家公派联合培养博士生,新加坡国立大学,应用数学
2009.09-2015.06 博士(硕博连读),华南理工大学,计算机应用技术
2006.09-2009.06 学士,华南理工大学,计算机科学与技术(联合班)
工作经历
2018.03-至今 副教授(讲师2018.03-2021.01),广东工业大学
2015.10-2018.03 博士后,华南理工大学
学术兼职
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员,广东省精准医学应用学会医工结合分会委员会委员,广东省生物医学工程学会医疗机器人与人工智能分会委员,中国计算机学会(CCF)会员、中国生物工程学会终身会员、广东省生物医学工程学会会员。目前担任Briefings in Bioinformatics, Frontiers in Genetics, BMC Bioinformatics,Scientific reports, BMC Medical Informatics and Decision Making, Frontiers in Bioscience-Landmark等生物信息学领域重要期刊的审稿人。
近三年主要论文(通讯作者标*)
[1] Haonan Huang, Yuping Sun (孙宇平)*, Meijing Lan*, Huizhe Zhang, Guobo Xie, “GNAEMDA: microbe-drug associations prediction on graph normalized convolutional network,” IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 10.1109/JBHI.2022.3233711, 2023. (IF: 5.772, SCI一区, CCF C)
[2] Qing Su, Enhai Ou, Yuping Sun (孙宇平)*, Chunyan Lv*, Guobo Xie, Haoqing Wang, Honglin Huang, “SimH: a novel representation learning model with activation and projection mechanisms for COVID-19 knowledge bases,” IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 26(12): 5859-5869, 2022. (IF: 5.772, SCI一区, CCF C)
[3] Guobo Xie, Zelin Jiang, Zhiyi Lin*, Guosheng Gu, Yuping Sun (孙宇平), Qing Su, Ji Cui, Huizhe Zhang, “DHOSGR: lncRNA-disease association prediction based on decay high-order similarity and graph-regularized matrix completion,” Current Bioinformatics, 18: 92-104, 2022. (IF: 4.850, SCI四区)
[4] Guobo Xie, Haojie Xu, Jianming Li, Guosheng Gu*, Yuping Sun (孙宇平), Zhiyi Lin, Yinting Zhu, Weiming Wang, Youfu Wang, Jiang Shao, “DRPADC: A novel drug repositioning algorithm predicting adaptive drugs for COVID-19,” Computers & Chemical Engineering, 10.1016/j.compchemeng.2022.107947, 2022. (IF: 4.130, SCI二区)
[5] Guobo Xie, Yinting Zhu, Zhiyi Lin*, Yuping Sun (孙宇平), Guosheng Gu, Jianming Li, Weiming Wang, “HBRWRLDA: predicting potential lncRNA–disease associations based on hypergraph bi-random walk with restart,” Molecular Genetics and Genomics, 297:1215–1228, 2022. (IF: 3.291, SCI三区)
[6] Huizhe Zhang, Juntao Fang# , Yuping Sun (孙宇平)*, Guobo Xie, Zhiyi Lin, Guosheng Gu, “Predicting miRNA–disease associations via node-level attention graph auto-encoder,” IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 10.1109/TCBB.2022.3170843, 2022. (IF: 3.710, SCI三区, CCF B)
[7] Guobo Xie, Jiawei Jiang and Yuping Sun (孙宇平)*, “LDA-LNSUBRW: lncRNA-disease association prediction based on linear neighborhood similarity and unbalanced bi-random walk,” IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 19(2): 989-997, 2022. (IF: 3.710, SCI三区, CCF B)
[8] Tianrong Chen, Jie Ling*, Yuping Sun (孙宇平), “White-box content camouflage attacks against deep learning,” Computers & Security, 117: 102676, 2022. (IF: 4.438, SCI三区, CCF B)
[9] Guobo Xie, Jianming Li, Guosheng Gu*, Yuping Sun (孙宇平), Zhiyi Lin, Yinting Zhu, and Weiming Wang, “BGMSDDA: A bipartite graph diffusion algorithm with multiple similarity integration for drug-disease association prediction,” Molecular Omics, 17, 997-1011, 2021. (IF: 3.743, SCI四区)
[10] Guobo Xie, Hui Chen, Yuping Sun (孙宇平)*, Guosheng Gu, Zhiyi Lin, Weiming Wang, Jianming Li, “Predicting circRNA-disease associations based on deep matrix factorization with multi-source fusion,” Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 13(4), 582-594, 2021. (IF: 2.233, SCI三区)
[11] Guobo Xie, Yinting Zhu, Zhiyi Lin*, Yuping Sun (孙宇平), Guosheng Gu, Weiming Wang and Hui Chen, “HOPMCLDA: predicting lncRNA-disease association through High-Order Proximity and Matrix Completion,” Molecular Omics, 17, 760-768, 2021. (IF: 3.743, SCI四区)
[12] Guobo Xie, Bin Huang, Yuping Sun (孙宇平)*, Changhai Wu, Yuqiong Han, “RWSF-BLP: a novel lncRNA-disease association prediction model using random walk based multi-similarity fusion and bidirectional label propagation,” Molecular Genetics and Genomics, 296, 473–483, 2021. (IF: 3.291, SCI三区)
科研项目
1) 国家自然科学基金青年项目(62002070),在研,主持。
2) 广州市科技计划基础与应用基础研究项目(202102021236),在研,主持。
3) 中山大学广东省计算科学重点实验室开放课题基金(2021013),在研,主持。
4) 国家自然科学基金面上项目(62076073),在研,参与。
5) 广州市科技计划产业技术重大攻关计划(201902020006),在研,参与。
6) 国家自然科学基金面上项目(61872151),在研,参与。
7) 广东省科技计划协同创新与平台环境建设项目(2018A050506013),结题,参与。
8) 广东省自然科学基金博士启动项目(2017A030310364),结题,主持。
9) 广州市科技项目科学研究专项一般项目(201707010147),结题,参与。
10) 广东省自然科学基金面上项目(2017A030313382),结题,参与。
11) 国家自然科学基金面上项目(61672241),结题,参与。
12) 广东省自然科学基金面上项目(2016A030313516),结题,参与。
13) 国家自然科学基金面上项目(61273255),结题,参与。
个人主页及招生要求
https://teacher.gdut.edu.cn/sunyuping/zh_CN/index.htm
https://www.researchgate.net/profile/Yuping-Sun-7
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